Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms