Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms