Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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