Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms