Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms