Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRSF2Q01130 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms