Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 OTOG-201ENST00000342528 4992 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CACNA1C-207ENST00000399597 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CACNA1C-208ENST00000399601 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CACNA1C-217ENST00000399641 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CACNA1C-218ENST00000399644 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 KCNA4-201ENST00000328224 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MIS18BP1-201ENST00000310806 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 KDM5D-202ENST00000382806 5134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ERBB2-219ENST00000584601 4792 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 OR10H5-202ENST00000642092 7044 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ALS2CL-201ENST00000318962 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 LARP4B-201ENST00000316157 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CEP89-201ENST00000305768 5678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 FAM200B-223ENST00000622362 4377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CELSR2-201ENST00000271332 10534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 EMG1-202ENST00000599672 4898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms