Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK1P39086 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms