Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSFA2P28290 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms