Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms