Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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