Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms