Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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