Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 STAT6-203ENST00000537215 2886 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 C11orf54-215ENST00000617482 2417 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC009227.1-201ENST00000434635 2362 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 PRR5L-201ENST00000378867 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CACNA2D4-219ENST00000585708 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 USF1-203ENST00000368021 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 RALA-201ENST00000005257 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ZNF423-204ENST00000562520 4018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 EPB41L1-203ENST00000373941 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 DPH2-201ENST00000255108 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SHANK2-AS1-201ENST00000429561 2252 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 SLC5A11-209ENST00000567758 2246 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 LINC00473-205ENST00000584911 2212 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 WDR76-202ENST00000381246 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 C1S-203ENST00000402681 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 RAD52-204ENST00000430095 2366 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 LINC00319-202ENST00000448049 3507 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AL590438.1-201ENST00000607061 3461 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CALCOCO1-202ENST00000430117 2706 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 LINC01588-203ENST00000529902 4279 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 LINC01471-201ENST00000461398 3079 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AC093426.1-201ENST00000561926 3011 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ANKRD39Q53RE8 THOC5-204ENST00000397873 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms