Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IHHQ14623 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IHHQ14623 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms