Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms