Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms