Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DEFA5Q01523 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms