Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms