Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OTX2P32243 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms