Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms