Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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