Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMED7Q9Y3B3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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