Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
XCL2Q9UBD3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms