Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RNF212Q495C1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms