Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP4Q13115 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP4Q13115 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP4Q13115 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP4Q13115 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
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DUSP4Q13115 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP4Q13115 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP4Q13115 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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DUSP4Q13115 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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DUSP4Q13115 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP4Q13115 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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DUSP4Q13115 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP4Q13115 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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DUSP4Q13115 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP4Q13115 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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DUSP4Q13115 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DUSP4Q13115 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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DUSP4Q13115 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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DUSP4Q13115 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUSP4Q13115 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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