Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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