Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HBG1P69891 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HBG1P69891 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HBG1P69891 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HBG1P69891 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms