Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms