Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TAF6P49848 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms