Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRXP46100 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CST2-201ENST00000304725 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 FKBP4P7-201ENST00000433874 1363 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRXP46100 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 TRAIP-202ENST00000469027 1145 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC078925.1-201ENST00000535370 568 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRXP46100 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ATRXP46100 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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