Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSR1P43307 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms