Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 280.3 ms