Protein–RNA interactions for Protein: A6NJG2

SOWAHD, Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHD, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOWAHDA6NJG2 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOWAHDA6NJG2 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOWAHDA6NJG2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOWAHDA6NJG2 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOWAHDA6NJG2 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SOWAHDA6NJG2 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SOWAHDA6NJG2 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOWAHDA6NJG2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms