Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms