Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms