Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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