Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW33

GTSF1, Gametocyte-specific factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSF1Q8WW33 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms