Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FHOD3Q2V2M9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FHOD3Q2V2M9 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms