Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms