Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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COL24A1Q17RW2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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COL24A1Q17RW2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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COL24A1Q17RW2 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms