Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms