Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms