Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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