Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BCAMP50895 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BCAMP50895 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BCAMP50895 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BCAMP50895 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BCAMP50895 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BCAMP50895 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BCAMP50895 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BCAMP50895 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BCAMP50895 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BCAMP50895 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BCAMP50895 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BCAMP50895 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCAMP50895 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms