Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSOP43234 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSOP43234 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSOP43234 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSOP43234 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSOP43234 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSOP43234 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSOP43234 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTSOP43234 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSOP43234 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSOP43234 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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