Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRG2P13727 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRG2P13727 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRG2P13727 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRG2P13727 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRG2P13727 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRG2P13727 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRG2P13727 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRG2P13727 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRG2P13727 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRG2P13727 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRG2P13727 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms