Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HHLA1C9JL84 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HHLA1C9JL84 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms