Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CEP44Q9C0F1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms