Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM31Q9BZY9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms